3月2日，南京市2016年中招政策正式出台：3月9日～10日网上报名；6月18日～19日文化考试，7月初发布中考成绩后网上填报升学志愿，随后招生学校分为4个批次进行网上远程录取。今年继续实行公办普通高中“零择校”。
今年中考成绩总分为700分。各学科满分分别为：语文、数学、英语(含听力口语考试)各120分，物理100分，化学80分，思想品德、历史各60分，体育40分。
去年南京首次试行城乡部分热点高中在一定范围内打通招生，改变了往年对“原五县”是计划只分配到区的做法。2016年起，南京师范大学附属中学、金陵中学、第一中学、中华中学等4所市属普通高中的指标生，将按一定比例面向全市所有初中校分配。南京市教育局将根据初中校生源分布情况，兼顾现有普通高中的招生管理格局、市属普通高中的办学条件以及往年指标生的分配办法，确保每所初中校都有市属普通高中的指标生计划，实现全市域覆盖。2017年起，所有在第一批次招生的普通高中统招生面向全市招生。2018年起，所有普通高中统招生面向全市招生。
2016年南京中招继续实行“见分填志愿”，凡按成绩和志愿投档、符合学校录取条件的考生均不得要求退档。2016年，南京中考将采用江苏高考近两年填报志愿的加密方式，使用动态口令卡。在初中校布置填报升学志愿的家长会上，向考生监护人发放动态口令卡，每张动态口令卡上都印有一个唯一的序列号，与考生对应绑定，使用前覆盖有可刮开的涂层。在网上模拟和正式填报志愿期间，考生和监护人每次登录系统时，在屏幕上除了输入自己设置的密码外，还必须输入动态口令，验证通过后方可登录，提交的信息方可保存。在填报志愿期间，考生志愿处于加密状态，初中校和招生部门只能监控志愿填报进度，看不到志愿具体内容。考生填报志愿时间截止，修改权限立即关闭，最后生成的信息即为确定志愿，任何人不得更改。6月29日下午或30日，考生可到初中校领取中考成绩单，也可访问南京教育信息网查询成绩和总分位次，还可通过固定电话和手机短信息查询。7月1日～2日网上填报升学志愿；7月5日，公布各批次投档控制线；开通网络查询升学志愿通道。7月6日～20日，远程网上录取；开通电话和网络查询录取情况通道。